Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna3P16390 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna3P16390 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna3P16390 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna3P16390 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna3P16390 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna3P16390 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcna3P16390 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcna3P16390 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcna3P16390 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna3P16390 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms