Protein–RNA interactions for Protein: P0C028

Nudt11, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 3-beta, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt11P0C028 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt11P0C028 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nudt11P0C028 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt11P0C028 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt11P0C028 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt11P0C028 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt11P0C028 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt11P0C028 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt11P0C028 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt11P0C028 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt11P0C028 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt11P0C028 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms