Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NclP09405 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NclP09405 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NclP09405 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NclP09405 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NclP09405 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NclP09405 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NclP09405 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NclP09405 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NclP09405 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NclP09405 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NclP09405 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NclP09405 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NclP09405 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NclP09405 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NclP09405 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NclP09405 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
NclP09405 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NclP09405 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NclP09405 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NclP09405 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NclP09405 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NclP09405 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NclP09405 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NclP09405 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NclP09405 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NclP09405 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NclP09405 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NclP09405 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NclP09405 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NclP09405 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NclP09405 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NclP09405 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NclP09405 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NclP09405 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NclP09405 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NclP09405 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NclP09405 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NclP09405 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NclP09405 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NclP09405 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NclP09405 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NclP09405 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NclP09405 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NclP09405 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NclP09405 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NclP09405 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NclP09405 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NclP09405 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NclP09405 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NclP09405 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NclP09405 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NclP09405 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NclP09405 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NclP09405 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NclP09405 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NclP09405 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NclP09405 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NclP09405 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NclP09405 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NclP09405 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NclP09405 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NclP09405 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NclP09405 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NclP09405 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NclP09405 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NclP09405 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NclP09405 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NclP09405 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NclP09405 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NclP09405 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NclP09405 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NclP09405 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NclP09405 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NclP09405 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NclP09405 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NclP09405 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NclP09405 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NclP09405 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NclP09405 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NclP09405 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NclP09405 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NclP09405 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NclP09405 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NclP09405 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NclP09405 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NclP09405 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NclP09405 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NclP09405 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NclP09405 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NclP09405 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NclP09405 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NclP09405 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NclP09405 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NclP09405 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NclP09405 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NclP09405 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NclP09405 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NclP09405 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NclP09405 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms