Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01797 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01797 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01797 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01797 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01797 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01797 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01797 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01797 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01797 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01797 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01797 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01797 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01797 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01797 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01797 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01797 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01797 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01797 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01797 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01797 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01797 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01797 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01797 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01797 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01797 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01797 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01797 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01797 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01797 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01797 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01797 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01797 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01797 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01797 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01797 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01797 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01797 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01797 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01797 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01797 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01797 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01797 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01797 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01797 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01797 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01797 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01797 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01797 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01797 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01797 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01797 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01797 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01797 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01797 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms