Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx8O88983 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx8O88983 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx8O88983 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx8O88983 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx8O88983 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx8O88983 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms