Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
StrnO55106 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
StrnO55106 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
StrnO55106 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
StrnO55106 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StrnO55106 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
StrnO55106 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StrnO55106 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StrnO55106 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StrnO55106 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StrnO55106 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StrnO55106 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
StrnO55106 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
StrnO55106 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
StrnO55106 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
StrnO55106 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
StrnO55106 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
StrnO55106 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
StrnO55106 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
StrnO55106 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
StrnO55106 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
StrnO55106 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
StrnO55106 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
StrnO55106 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
StrnO55106 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
StrnO55106 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
StrnO55106 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
StrnO55106 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
StrnO55106 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StrnO55106 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.31■■□□□ 1
StrnO55106 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StrnO55106 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
StrnO55106 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
StrnO55106 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StrnO55106 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
StrnO55106 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StrnO55106 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms