Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rabep1O35551 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms