Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms