Protein–RNA interactions for Protein: O35242

Nsmaf, Protein FAN, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmafO35242 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmafO35242 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NsmafO35242 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmafO35242 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmafO35242 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmafO35242 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmafO35242 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmafO35242 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmafO35242 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NsmafO35242 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmafO35242 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmafO35242 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmafO35242 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmafO35242 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmafO35242 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmafO35242 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmafO35242 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmafO35242 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmafO35242 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmafO35242 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmafO35242 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmafO35242 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms