Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbip1J3QMK2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbip1J3QMK2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms