Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem200cJ3QK46 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms