Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r194J3JS27 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms