Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rfx7F8VPJ6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms