Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.5 ms