Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn7aB1AYL1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.4 ms