Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms