Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
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Trpc3Q9QZC1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Trpc3Q9QZC1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Trpc3Q9QZC1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Trpc3Q9QZC1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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Trpc3Q9QZC1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpc3Q9QZC1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc3Q9QZC1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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