Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms