Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VapbQ9QY76 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms