Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms