Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmgn5Q9JL35 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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