Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Extl1Q9JKV7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Extl1Q9JKV7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms