Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms