Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms