Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OtofQ9ESF1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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