Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx12Q9ER00 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms