Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc46a3Q9DC26 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms