Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic1Q9DC16 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms