Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z1

Knstrn, Small kinetochore-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KnstrnQ9D9Z1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KnstrnQ9D9Z1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KnstrnQ9D9Z1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KnstrnQ9D9Z1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms