Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfn4Q9D6I3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms