Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1ip1Q9CQ20 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1ip1Q9CQ20 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms