Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim3Q99PE5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms