Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsnaxip1Q99P25 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms