Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a6bQ99N09 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a6bQ99N09 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms