Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Abcf2Q99LE6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Abcf2Q99LE6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Abcf2Q99LE6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Abcf2Q99LE6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Abcf2Q99LE6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Abcf2Q99LE6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcf2Q99LE6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcf2Q99LE6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcf2Q99LE6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcf2Q99LE6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcf2Q99LE6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcf2Q99LE6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcf2Q99LE6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms