Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gps1Q99LD4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gps1Q99LD4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms