Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krcc1Q99JT5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms