Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ophn1Q99J31 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ophn1Q99J31 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ophn1Q99J31 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ophn1Q99J31 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ophn1Q99J31 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ophn1Q99J31 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ophn1Q99J31 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ophn1Q99J31 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms