Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms