Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms