Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms