Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc15Q8C9M2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc15Q8C9M2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc15Q8C9M2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc15Q8C9M2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms