Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms