Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc30Q8BVF4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc30Q8BVF4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms