Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SynmQ70IV5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SynmQ70IV5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SynmQ70IV5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms