Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot1Q6ZQ08 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 751.2 ms