Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ssxb10Q6XAR7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ssxb10Q6XAR7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Ssxb10Q6XAR7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Ssxb10Q6XAR7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ssxb10Q6XAR7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ssxb10Q6XAR7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ssxb10Q6XAR7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ssxb10Q6XAR7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssxb10Q6XAR7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssxb10Q6XAR7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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