Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrn2Q6PHP6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms