Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ecm29Q6PDI5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ecm29Q6PDI5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms