Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smchd1Q6P5D8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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